安全、速度、资金、管理等等，构成了高寒高铁新的问题。中国在修建高寒高铁时，至少面临以下方面的挑战。

　　一是巨额资金筹集难度大。东北北部和北疆地区是我国能源与重工业基地，人口还比较密集，资金相对来讲，要容易筹集一些，但是也存在着资金吃紧的情况，而且每年还要支付巨额的利息。如果在内蒙和海外修建高寒高铁，融资难度可能会更大。修建高寒高铁如欧亚高铁、中俄加美高铁等所需资金将是一个天文数字，绝非中国一国政府可以承担。即便沿线国家愿意为高铁提供部分资金，仍无法满足需求。

　　二是铁路运营将是一个难题。高寒高铁不同季节和时间，有不同的运行规律和方法。尤其是在严寒的冬天，铁路安全管理难度加大，给运营造成困难。欧亚高铁、中俄加美高铁要穿越多个国家，如何管理和运营这条跨国高速铁路系统将是一个巨大挑战。如果沿线国家无法就高铁运营达成一致，后续合作便无从谈起。

　　三是运营效率制约高寒高铁发展。在严寒地区，人口较少，人口密度和城镇化都比较低，投入和产出往往不是成正比。如果没有良好的运营效率，那如今修建这样的高铁意义就不是很大。

　　四是技术难题仍然较大。在西北沙漠地带,防风沙是高寒高铁的技术难题,尽管在高铁沿线部分路段安装了防风沙的护网,但是给生态还是带来了一定的干扰,另外经济成本也无形增大了很多。欧亚大陆是世界上最大的大陆，欧亚高铁和中俄加美沿线的地质条件极为复杂，既有高山险谷也有河流湖泊和海峡，修建穿越如此多复杂地质环境的高速铁路在技术上面临巨大挑战。