据介绍，地铁3号线所用列车最大运行速度将达每小时100公里，定员载客1440人，超员载客量可达1822人。根据前期调查，3号线晚高峰为全日最大客流时段，而且潮汐现象较严重，不均衡系数达1.67。从发送客流量来看，特区内部、特区与龙岗区之间、龙岗区内部三段客流各占1／3,分布相对均衡。

据地铁3号线投资公司有关负责人介绍，3号线投入运营后，运营时间为每天早6时至晚24时。在2012年前，早晚高峰时段每小时对开12列列车，行车间隔8分钟，高峰小时单向最大设计输送能力为1.73万人次；至2019年，高峰时段每小时可对开25列列车，每3分钟即可发出一班车。